行政長官根據《澳門特別行政區基本法》第五十條（五）項，並根據澳門特別行政區第10/2000號法律第四十二條第一款規定，經徵詢行政會的意見，制定本行政法規。
一、廉政公署部門（葡文縮寫為SC）的宗旨是向廉政公署在按照其組織法規定履行職責時，提供所需的技術及行政輔助。
二、廉政公署部門乃具有職能、行政、財政及財產自治權的部門。
一、廉政公署所負責的行為及措施是由廉政專員或由助理專員、廉政公署部門人員在行使獲授予的權限時作出。
二、為進行培訓、技術性及臨時性的研究及工作，公署得在例外情況下與公共或私人實體訂立合同。
三、為遵守澳門特別行政區第10/2000號法律第六條第一款所規定的合作義務，該條所指的實體應將其所得悉及屬廉政公署工作範疇內的犯罪行為或違紀行為，以及在有關程序中所作的最後決定知會該公署，但不影響法定程序的進行。
四、如有需要時，廉政公署得僅跟進在由有權限實體進行的刑事或紀律程序。
五、為預防的目的，廉政專員得公開屬其權限所針對的範疇內因違法行為而提起的刑事或紀律程序的判罪或處分決定，以及任何有利於履行其職責的其他事實，但不影響澳門特別行政區第10/2000號法律第二十條規定的適用。
六、就廉政專員作出的行為，得向專員提出聲明異議，而就助理專員及廉政公署部門人員作出的行為，得向專員提出必要的訴願。
一、廉政公署部門由廉政專員領導，專員得將其權限授予助理專員或按照本行政法規的規定，授予廉政公署部門的領導及主管人員、顧問及技術顧問。
二、作為廉政公署部門領導機關的廉政專員，尤其有下列權限：
（一）訂定廉政公署部門的工作方針及內部運作規則；
（二）採取措施以編製廉政公署的預算及年度工作報告。
廉政公署部門包括：
（一）廉政專員辦公室；
（二）反貪局；
（三）行政申訴局。
一、廉政專員辦公室為一直屬該專員並輔助其履行職務的架構。
二、廉政專員辦公室包括：
（一）辦公室主任；
（二）顧問及技術顧問；
（三）私人秘書及辦公室助理。
三、廉政專員辦公室下設有綜合事務廳、社區關係廳及資訊中心。
辦公室主任協調廉政公署部門人事及財政管理，協調廉政專員辦公室及該辦公室轄下附屬單位的管理，按廉政專員指示負責分配工作予辦公室各成員，監管有關的活動及擔任廉政專員所交付的其他工作。
一、顧問按廉政專員直接或透過辦公室主任的指示，負責向廉政公署部門提供專門技術協助及擔任特定任務。
二、技術顧問負責擔任廉政專員或辦公室主任指定的特定任務。
一、私人秘書按照廉政專員直接或透過辦公室主任的指示負責：
（一）處理辦公室來往函件並確保其歸檔及安全；
（二）轉達面見廉政專員的要求及編製專員工作日誌；
（三） 確保履行由廉政專員或辦公室主任所指定的其他任務。
二、辦公室助理按照廉政專員的指示執行特定任務。
一、綜合事務廳主要負責輔助廉政公署部門的財政、財產及人事管理，進行研究工作及籌辦培訓活動。
二、綜合事務廳下設有行政財政處及研究組織部。
行政財政處主要負責：
（一） 編製本身預算案，以及有關的修正及修改，並確保將之執行；
（二） 編製年度管理帳目及有關報告；
（三） 按現行法律規定組織會計系統的運作；
（四） 確保出納活動、徵收收入及結算開支；
（五） 確保採購及管理文具的職務，以及資產及勞務取得的往來文件；
（六） 進行財產管理，並關注設施、設備及車輛的保養、安全及維修；
（七） 確保一般往來函件的工作及有關紀錄，以及編製及更新總檔案的工作；
（八） 確保有關人事管理的工作，以及編製及更新其檔案及往來函件的最新資料。
一、出納工作由一名司庫負責，司庫由廉政專員從行政財政處的人員中委任。
二、司庫無須作出擔保，並應依法律規定收取錯算補助。
三、司庫缺勤或因故不能視事時，由廉政專員指定其代任人。
四、廉政專員得根據七月十三日第30/98/M號法令第六條的規定，透過批示設立常備基金，以應付不可延遲的開支，並交由司庫或其代任人掌管。
五、支票以及有關收取款項及動用存款的其他文件，由廉政專員或辦公室主任及司庫簽署。
一、研究組織部主要負責：
（一） 進行廉政專員指定的研究項目，尤其是關於外地的反貪部門及申訴部門的組織及運作；
（二） 協助公署編製工作計劃及報告書；
（三） 籌辦培訓活動；
（四） 研究及建議內部文件流程及將公署專用表格規範化；
（五） 確保公署的翻譯工作；
（六） 管理公署的文獻中心。
二、得設立職務主管以協調研究組織部的工作。
一、社區關係廳主要負責確保公署與社會的聯繫，向公眾灌輸遏止及預防貪污及行政違法行為的意識，以及處理有關公署活動及有利公署工作的訊息。
二、社區關係廳下設有宣傳教育處及公關新聞部。
宣傳教育處主要負責：
（一）籌備及推廣對市民有益的刊物；
（二）向公眾進行宣傳教育工作，以遏止貪污及行政違法行為；
（三） 推廣預防貪污及行政違法行為的措施，旨在促使公共行政更公平、公正及更具透明度。
一、公關新聞部主要負責：
（一）接待前往公署的人士；
（二）確保向公眾提供資訊服務；
（三） 收集、分析、處理、存檔、傳播由傳播媒體發出關於公署活動的資訊及對履行公署職責有明顯利益的消息；
（四） 與傳播媒體聯繫，並跟進擬公開的資料的製作及推廣；
（五）按廉政專員指示協助傳播媒體。
二、得設立職務主管以協調公關新聞部的工作。
一、資訊中心主要負責：
（一） 執行公署電腦化計劃；
（二） 確保所採用的資訊器材的運作及優化其使用；
（三） 不斷了解在資訊器材方面的需要，並作出取得有關器材的建議；
（四） 勘察、收集、處理及傳播數位化資訊資料；
（五） 在資訊技術方面，促進實現澳門特別行政區第10/2000號法律第六條第四款的規定。
二、得設立職務主管以協調資訊中心的工作。
一、反貪局負責公署職責及權限所針對範疇內的犯罪及行為的調查及偵查工作及其他相關工作，以及組織和確保六月二十九日第3/98/M號法律所規定的收益及財產利益聲明卷宗的處理工作。
二、對於兼屬刑事及行政申訴範疇的個案，由反貪局局長負責與行政申訴局協調處理。
三、反貪局由一名局長領導，局長一職由一名助理專員當然兼任。
四、反貪局下設有調查一廳、調查二廳及技術支援廳。
一、調查一廳及調查二廳負責查明公署職責及權限所針對範疇內的犯罪及行為的跡象或消息。
二、如上條第一款所指犯罪及行為的案情複雜或涉及其他犯罪活動，調查工作交由調查一廳負責。
三、如上條第一款所指犯罪及行為的調查程序較簡單快捷，調查工作則交由調查二廳負責。
四、調查二廳亦負責：
（一） 與有助履行反貪局職務的外地機構聯絡及協查案件；
（二） 統籌保護證人的工作；及
（三） 在公署的職責範疇內，預防及遏止在因應澳門特別行政區機關選舉而進行的選民登記及有關選舉中出現貪污行為及欺詐行為。
五、調查一廳及調查二廳各由一名總調查主任領導，而總調查主任職級等同廳長職級。
六、調查一廳及調查二廳下得設立調查小組以執行其工作。
一、技術支援廳主要負責：
（一）收集為履行反貪局職務所需的情報；
（二）保管武器，彈藥及戒護物品；
（三）為廉政公署進行的偵查及調查提供所需的技術資源；
（四）保存證物；
（五）協助公署進行內部調查；
（六）接收投訴及檢舉；
（七）確保卷宗的保存及處理；
（八）組織及確保六月二十九日第3/98/M號法律規定的收益及財產利益聲明卷宗的處理工作。
二、技術支援廳由一名總調查主任領導，而總調查主任職級等同廳長職級。
一、行政申訴局負責分析及處理行政申訴，研究及建議發出勸喻，旨在簡化行政程序及改善公共部門運作，以及研究及分析有利於預防及遏止行政違法、貪污及由公務員作出的欺詐行為的措施。
二、對於兼屬刑事及行政申訴範疇的個案，由行政申訴局局長負責與反貪局協調處理。
三、行政申訴局由一名局長領導，局長一職由一名助理專員當然兼任。
四、行政申訴局下設有調查三廳及審查廳。
一、調查三廳主要負責：
（一） 接收投訴及檢舉；
（二） 自行或要求公共部門採取調查措施及收集證據，以查明行政行為或行政程序的違法或不公正情況的跡象；
（三） 透過非正式途徑與被投訴的部門接觸，謀求及時及盡快糾正違法或不公正的行政行為或行政程序；
（四） 建議廉政專員向有權限的部門提出勸喻，以糾正違法或不公正的行政行為或行政程序；
（五） 就所查清的違法行為跡象，促請廉政專員向有權進行紀律程序的實體檢舉；
（六） 因應情況所需，跟進在有權限實體進行的紀律程序；
（七） 履行為行使法律賦予廉政公署的權力而經廉政專員指定的職務。
二、調查三廳由一名總調查主任領導，而總調查主任職級等同廳長職級。
三、調查三廳下得設立調查小組以執行其工作。
一、審查廳主要負責：
（一）研究簡化行政程序的方法及有利於預防及遏止行政違法、貪污及由公務員作出的欺詐行為的措施；
（二） 監督涉及財產利益行為的合規範性及行政正確性；
（三） 因應情況所需，在公署的職責及權限範疇內製作意見書及研究報告，以便將之送交有關公共部門或透過公署的相關部門予以公開；
（四） 研究措施，以改善公共部門的運作及增加其工作的透明度；
（五） 研究對人的權利、自由、保障或正當利益造成影響的規定是否合法；
（六） 指出所發現的法例缺點，提出勸喻以便解釋、修改或廢止有關法例，又或建議制定新法例；
（七） 提議廉政專員向行政長官建議作出規範性行為，以改善公共部門的運作及對依法行政的遵守，尤其消除各種有利於貪污及實施不法或道德上應受責備的行為的因素；
（八） 履行為行使法律賦予廉政公署的權力而經廉政專員指定的職務。
二、審查廳在履行其職務時，得與有權限的機關及部門合作，以謀求最適當的解決方法。
三、審查廳由一名總調查主任領導，而總調查主任職級等同廳長職級。
四、審查廳下得設立小組以執行其工作。
廉政公署部門的財政制度等同自治實體的財政制度，具專有的會計格式。
一、廉政公署部門的收入包括：
（一）澳門特別行政區總預算的配備撥款；
（二）歷年管理的結餘；
（三）本身可動用資金的利息；
（四）轉讓本身資產的所得；
（五）法律指定的其他收入。
二、經行政長官許可後，廉政公署部門方可將流動款項資本化。
一、廉政公署部門的開支為：
（一）因運作而產生的負擔，尤其在人員、資產及勞務的取得、轉移、其他經常性開支及資本性開支等方面的負擔；
（二） 有關屬行政當局負擔而須轉送退休基金會、社會保障基金或其他福利機構的退休金及撫卹金的每月供款。
二、廉政專員權限內的開支許可限額係由行政長官以批示訂定。
廉政公署的財產係由公署為履行其職責或於履行其職責時所取得的全部資產及權利組成。
一、本行政法規規定的制度適用於廉政公署部門的人員，而公職的一般制度亦補充適用於廉政公署部門的人員。
二、法院或檢察院的司法官及司法機關的人員，不論被委任的職務為何，得根據現行法例的規定，隨時選擇其原職程或原官職的報酬制度，但不影響上款規定的適用。
三、工作表現評核一般制度中有關評核諮詢委員會的規定，不適用於調查員，但不影響其聲明異議權及上訴權。*
* 附加 - 請查閱：第13/2005號行政法規
一、廉政專員辦公室人員的通則及聘任制度等同司長辦公室人員的相應職位者，但專員辦公室轄下附屬單位人員除外。
二、除領導及主管人員外，廉政公署部門其他輔助人員及根據澳門特別行政區第10/2000號法律第三十二條規定按臨時安排制度工作的人員，得按其有關基礎薪俸的數額計算，另收取透過廉政專員的批示而訂定至其基礎薪俸的數額30%的酬勞，但不得因超時工作而與其他酬勞或補助兼併收取。
三、廉政公署部門人員不得從事有酬或無酬的其他公職或任何私人業務；但屬不與工作時間重疊且經廉政專員事先許可的教學、學術研究或公務員提供職業培訓的工作，不在此限。
一、上條所指人員的正常任職制度為定期委任，但不影響澳門特別行政區第10/2000號法律第三十條規定的適用。
二、以確定委任任用的司法官以定期委任制度在廉政公署提供服務的時間，為著年資及退休的效力，均視為在原職級所提供服務的時間。
三、澳門特別行政區行政當局的公務員或服務人員得以定期委任、徵用或派駐等方式在廉政公署部門任職。
四、以徵用或派駐的方式在廉政公署部門工作的人員，不受十二月二十一日第87/89/M號法令核准的《澳門公共行政工作人員通則》第三十三條及第三十四條所規定的任職期限約束。
處於退休狀況的人員如被委任在廉政公署部門任職，適用公職一般制度所規定的相關報酬制度，但須遵守第二十八條第三款的規定。
廉政公署部門的人員配備，載於屬本行政法規組成部分的附件一*，經廉政專員建議，行政長官得以行政命令修改之。
* 已更改 - 請查閱：第28/2003號行政命令
廉政專員、助理專員及其他人員如為司法官員，得選擇現行法律規定的本身通則，但不影響澳門特別行政區第10/2000號法律規定的適用。
為存檔的目的，廉政專員得下令編製副本或縮微本，以取代有關的文件。該等副本或縮微本，經過適當認證後，具有原件的證明力。
廉政公署的標誌載於本行政法規組成部分的附件二。
根據澳門特別行政區第10/2000號法律第三十五條規定的工作證的名稱及式樣載於屬本行政法規組成部分的附件三；經廉政專員建議後，工作證的名稱及式樣得由行政長官以批示修改。
廉政公署人員，不論其任用方式，轉入新組織架構的相應職位，並保持原有職務上的法律狀況。
行政長官在廉政公署部門的執行預算方面的權限，由廉政專員行使。
在廉政公署部門的預算開始生效前，因本行政法規的施行而引致的負擔，由財政局從各項撥款中調配款項予以支付。
廢止載於澳門特別行政區第6/1999號行政法規附件十有關廉政公署的自由通行證及工作證式樣。
本行政法規於公佈之翌日開始生效。
二零零零年八月十七日制定。
命令公佈。
行政長官 何厚鏵
| 人員組別 | 級別 | 官職/職程 | 職位數目 |
| 領導及主管 | — | 辦公室主任 | 1 |
| 領導及主管 | — — — — |
顧問/技術顧問 廳長 總調查主任 處長 |
6 2 5 2 |
| 高級技術員 | 9 | 高級技術員 | 6 |
| 高級資訊技術員 | 9 | 高級資訊技術員 | 2 |
| 翻譯員 | — | 翻譯員 | 1 |
| 私人秘書 | — | 私人秘書 | 2 |
| 辦公室助理 | — | 辦公室助理 | 1 |
| 技術員 | 8 | 技術員 資訊技術員 |
4 1 |
| 調查員 | — | 調查員 | 52 |
| 專業技術員 | 7 | 技術輔導員 公關督導員 資訊督導員 |
13 1 1 |
| 行政人員 | 5 | 助理技術員 文員 |
6 3 |
| 總數： | 109 |
* 已更改 - 請查閱：第28/2003號行政命令
一、特別工作證的名稱為“自由通行”證，普通工作證的 名稱為“工作證”。
二、式樣一證件為廉政專員專用，式樣二證件供具有刑事警察權力的廉政公署人員使用，式樣三證件供具有執法人員地位的廉政公署人員使用，而式樣四證件供其餘的廉政公署人員使用。
三、證件預先印有中文及葡文，並應填寫持證人的姓名及以中、葡文寫上所擔任的職務。
四、證件為白色，為B8尺寸（88毫米X62毫米）。
五、式樣一證件的有效要件為行政長官的簽名及在相片左下角蓋上行政長官辦公室的鋼印。
六、式樣二、式樣三及式樣四證件的有效要件為廉政專員的簽名及在相片左下角蓋上廉政公署部門的鋼印。
七、證件在其持證人行使職能期間有效。
八、應在獨立的登記簿冊將所有發出的證件作成列表，尤其須載明登記編號、證件式樣、持證人姓名、有關官職或職級和發出日期。
九、證件所載資料有任何修改時，應予以更換。持證人確定或暫時終止行使其職能時，必須將證件交還有關部門。
十、證件如有遺失、損毀或殘破，應予以補發，但須在登記簿冊中作明確記錄，並保存與原證件同一的編號。
